De bijwerkingen van antidepressiva variëren, afhankelijk van de dosis en individuen. De mogelijke bijwerkingen zijn sedatie, gewichtstoename, droge mond, urineretentie, obstipatie, orthostatische hypotensie (een plotselinge daling van de bloeddruk bij het opstaan), en seksuele disfunctie.
Zoals met andere medicijnen, bijwerkingen varieert per individu en de dosis. De mogelijke bijwerkingen zijn vochtretentie, seksuele disfunctie, waaronder verminderde beweeglijkheid van de zaadcellen (het vermogen van het sperma om te bewegen of te zwemmen), obstipatie, gewichtstoename, en hartblok (interferentie met het hart elektrisch geleidingssysteem).
Er zijn geen grote, goed-gecontroleerde studies die bewijzen dat antidepressiva helpen migraine te voorkomen, dus ze zijn niet goedgekeurd door de FDA voor de behandeling van migraine. Maar veel hoofdpijn specialisten vinden deze groep van geneesmiddelen helpen. Aangenomen wordt deze geneesmiddelen werken door de serotonine (hersenen mededeling chemisch), voorzover zij werken depressie, angst, en andere serotonine gerelateerde stoornissen. De soorten antidepressiva die worden gebruikt voor de preventie van migraine zijn tricyclische antidepressiva, selectieve serotonine heropnameremmers (SSRI's) en serotonine en noradrenaline-heropnameremmers (SNRI).
De elektrische activiteit van hersencellen treedt op omdat stoffen, elektrolyten steken de hersenen celmembranen net als een stroom in een batterij. De kleine kanalen waarlangs de elektrolyten, zoals natrium en chloride, flow "gated" door calcium. De calciumantagonisten interageren met dit proces de elektrische activiteit verlagen. Deze interactie kan worden waarom deze bepaalde medicijnen helpen migraine te voorkomen. De enige calciumkanaalblokker beschikbaar in de VS, dat is gevonden enigszins bruikbaar met migraine te zijn is verapamil. Het is vooral nuttig voor basilaire migraine, hemiplegische migraine en migraine met aura (zie Soorten migraine, PP14-15).
